Великая Отечественная война — одна из самых трагических страниц в истории нашей Родины. Впервые представлены музейные коллекции: форма, оружие советских и немецких войск, личные вещи, редкие исторические документы, фотографии государственного архива и центра документации новейшей истории Краснодарского края об участии кубанцев в сражениях Великой Отечественной войны. Известие о начале войны население страны получило по радию и через репродукторы. Советские люди жили исключительно мирными человеческими интересами, не ожидая войны. Обычные предметы — мебель, книги любимых авторов, патефон или радио-тарелка, из которой вскоре раздастся сообщение о начале войны. Речь Заместителя Председателя Совнаркома и Наркома иностранных дел В. М. Молотова о вероломном нападении гитлеровской Германии на Советский Союз можно послушать по довоенному телефону.
С 9 августа 1942 по 9 октября 1943 года длилась оккупация Краснодарского края. Уничтожение советских людей в концлагерях, газовых «душегубках», трагедия Михизеевой Поляны (кубанская Хатынь). Экспонаты выставки хранят память о тяжелых испытаниях для страны и о людях, которые эти испытания вынесли. Роба, деревянная обувь и миска узника концлагеря Освенцим Николая Леонтьевича Белоруцкого.
14–17 июля 1943 г. в здании кинотеатра «Великан» состоялся первый судебный процесс по делу о зверствах оккупантов и их пособников. Листок заседания судебного процесса, в котором перечислены имена преступников, демонстрируется документальный фильм «Приговор народа».
Выставка насыщена большим количеством различных образцов оружия противоборствующих сторон, уникальной является коллекция холодного оружия (шашки, кинжал), принадлежавшего бойцам 4-го гвардейского кавалерийского казачьего корпуса. Они прошли боевой путь от Кубани до Праги, 22 воина этого корпуса получили звание Героя Советского Союза.
В период оккупации на Кубани действовали 86 партизанских отрядов. За мужество и героизм орденами и медалями были награждены 978 партизан. Неизменный интерес у посетителей вызывает воссозданный интерьер партизанской землянки, трофейные вещи, мотоцикл BMW.
Краснодарская наступательная операция с февраля по май 1943 года завершилась выходом советских войск на рубежи «Голубой линии» — мощного оборонительного рубежа немецко-фашистских войск. Об освобождении Кубани и прорыве «Голубой линии» в мае 1943 года повествует диорама «Атака на сопке Героев».